主人公的琉花是一个脾气略微急躁的普通少女，父母亲都在水族馆中工作，小的时候曾经在水族馆内见到过发光的鱼群，对其记忆尤深。因为琉花脾气的关系，她在中学第二个暑假被参加的运动社团给开除了，百无聊赖的她在去父亲 工作的水族馆中遇见了两名神秘的异国少年，“海”和“空”——据说是被儒艮所养大，可以长时间在 海中生存，且不能过久离开水源的孩子，并且开始了她之后所说的“最漫长的暑假”......

男主角是已经参加工作的成年人，他以与朋友们相见为契机再度回顾了自己的过往，逐渐开始与多年前就断绝了关系的母亲联系...

偶遇到神秘少年“海”和“空”的这个炎炎夏天，是琉花暑期的正式开始。天真无邪的“海”，看透一切的“空”，海洋馆里发光的鱼群，对琉花来说都像是一场浪漫的约定如期而至。

该片根据漫画家歌川泰司的漫画改编，讲述主人公在克服了虐待等母子间的问题后，重新又得到了母爱的故事。