《新·奥特曼》是由圆谷制作株式会社、东宝、凯乐联合制作的一部大电影。电影的年代设定在了现在，沿用了奥特曼的形象，设定和剧情都做了新的定义。地球开始源源不断地出现祸威兽，祸威兽每次出现都会造成巨大的破坏。人类为了守护自己的家园，成立了祸特队。祸特队负责专门处理祸威兽的事情。在人类的共同努力下，陆陆续续出现的祸威兽都被人类给驱逐或者消灭了。随着时间的推移，祸威兽变得越来越难对付，人类政府的开销也变得越来越多。在某次人类与祸威兽的战斗中，一位神秘巨人的出现，引起了所有人的关注，甚至连外星人都参与进来了。

幕府时代末期，外忧内患，山河动荡，百姓生活困苦，且生命时刻受到威胁。少年心太因其善良纯洁之心感动飞天御剑流高手比古清十郎，被其收入门下学习剑法，更名剑心。在国家危难之际，年轻的剑心怀揣改变时代的梦想下山，加入奇兵队，日后更被桂小五郎纳入麾下，以刽子手的身份为时代的变革尽一份绵薄之力。年仅15岁的剑心接连刺杀多名政府要员，令对手闻风丧胆，直到某一天，一名下级武士在他的脸上留下一道无法愈合的伤疤。来至京都寻找爱人的雪代巴邂逅了剑心，正是眼前这名瘦弱的男子将爱人从她的生命中带走。巴走入剑心的生活，随之经历了政治

集合了所有人的力量，佃制作所和帝国重工的无人拖拉机Landcrow终于完成了。然而，上市销售数周后，销售额却迟迟不见上涨。相比之下，Gear Ghost和Daedalus研发的达尔文销量却很好，双方差距因此越拉越大。为扭转局势，帝国重工的下任社长候选人的场想了个办法，那便是助达尔文小组一臂之力，同时给帝国重工的分包公司施压。由此，脱离达尔文小组的企业日渐增多，达尔文的库存也慢慢见了底。竞争对手的势头以这种意想不到的方式得到了制止，但佃制作所的成员们却心情复杂，因为这并非是源自消费者对自己技术水平的正当评价

花冈七樱和母亲以前共同居住在老牌和式点心店光月庵，她和青梅竹马的光月庵继承人高月椿是初恋对象，但是在15年前，高月椿的父亲被刺身亡事件发生后，警察根据当时年仅6岁的高月椿的证言将花冈七樱的母亲逮捕，花冈七樱也被光月庵所逐出。然而，花冈七樱的母亲在调查中去世了，此案至今仍留有谜团。15年后，花冈七樱与椿在一个点心对决比赛中再会。高月椿对花冈七樱制作的点心感兴趣，在没发现她是自己的青梅竹马的情况下，才“第一次”见面就提出了求婚。而花冈七樱为了证明母亲的清白，决定隐瞒真实身份，利用和高月椿结婚进入光月庵。但是在

为何曾经是街之守护使“鸦”的他会向人类复仇呢？忘记了夜晚的街，新宿。忘记邻接的妖怪的存在，流浪生活的人们。自古以来，互相纠绕的两个世界的秩序根据“百合音”和“鸦”被守护。不过，这里平衡正在很大程度地发生混乱。为了阻止杀人案继续发生，新的“鸦”诞生了，青年乙羽被选作新的守护者，新仇旧恨在新宿街头开始蔓延…